3 سپتامر 1940 ده بچه عجيب و غريب از لشكر هيولاهاي مرگ‌بار مي‌گريزند و فقط يك نفر مي‌تواند كمكشان كند - اما در قالب پرنده‌گير افتاده است. سفر خارق‌‌العاده‌اي كه در بچه‌هاي عجيب و غريب يتيم‌خانه خانم پرگرين آغاز شد ادامه دارد و جيكوب پورتمن و دوستان تازه‌يافته‌اش به لندن، پايتخت عجيب و غريب جهان، سفر مي‌كنند. اميدوارند آن‌جا براي خانم مدير محبوبشان، خانم پرگرين، درماني بيابند...